Вступила в строй 1 апреля 1962 года. C 21 апреля по 12 июня 1964 года сделала рекордное автономное плавание в воды Центральной Атлантики. Подводная лодка под командованием И. И. Гуляева побила рекорды по дальности автономного похода, продолжительности подводного плавания.
До 7 сентября 1965 года считалась в боевом составе как крейсерская подводная лодка (КрПЛ) и лишь потом была переведена в разряд опытовых.
24 мая 1968 года подводная лодка К-27 проекта 645 находилась в Баренцевом море. Проверялись характеристики ГЭУ на ходовых режимах опосля выполнения модернизационных работ. Мощность реактора в 11:30 самопроизвольно начала понижаться. Личный состав, не разобравшись в ситуации, попробовал поднять мощность ядерного реактора, но неудачно. В 12:00 в реакторном отсеке возросла до 150 Р/час гамма-активность и произошёл выброс радиоактивных газов в помещения реакторного отсека. Потому что это является признаком повреждения ядерного горючего, личный состав сбросил аварийную защиту левого реактора. Как выяснилось позднее, в итоге трагедии разрушилось около 20 % тепловыделяющих частей. Предпосылкой трагедии стало нарушение теплоотвода от активной зоны.
Радиационная обстановка на подводной лодке усугубилась. Лодка всплыла, провентилировала заражённые отсеки и на одном реакторе правого борта, который работал на обе турбины, добралась до базы. По прибытии выяснилось, что лодка имеет завышенный радиоактивный фон, в 17:30 пришвартовалась к внутреннему рейду. Личный состав был выведен из зоны радиоактивного инфецирования и выслан отдыхать.
Официальных данных о уровнях загрязнения подводной лодки, окружающей среды и уровнях облучения личного состава нет. Моряки-подводники в рамках секретности были выписаны из госпиталей с диагнозами «последствия острого астеновегетативного синдрома 1968 года».
В итоге трагедии реактора весь экипаж был переоблучён и перенёс острую лучевую заболевание, 20 человек получили дозы радиации от 600 до 1000 Р. Погибло 9 членов экипажа: один матрос задохнулся в противогазе конкретно на борту, восемь человек погибли позже в госпитале от приобретенных на борту больших доз радиации. 25 мая 1-ая партия — 10 человек матросов, в том числе все спецтрюмные, прибыла в 1 военно-морской госпиталь в Ленинграде, доставленная самолётом командующего Северным флотом С. М. Лобова. Они находились в спецотделении (11-е отделение), но восьмерым подводникам посодействовать не удалось. Другие пострадавшие в течение 2-ух суток были высланы в госпитали Ленинграда, Москвы и Североморска, где проходили исцеление.
Сама лодка лишь 1 февраля 1979 года была исключена из состава ВМФ СССР и 1 октября 1980 года расформирована. В сентябре 1982 года затоплена в Карском море у северо-восточного побережья архипелага Новенькая Земля на входе в залив Степового.